Ботанический сад, созданный при Томском университете в 1880 году, стал первым подобным учреждением в Сибири. Сейчас это обособленное структурное подразделение ТГУ, расположенное на 126 га, с оригинальным оранжерейно-тепличным комплексом в 6500 м² и уникальными для северных регионов планеты растительными фондами в 6000 видов, форм и сортов, расположенных в 9 лабораториях.
За прошедшее время его площадь увеличилась почти в 100 раз, с 1,2 до 126 гектаров. Увеличилась и коллекция растений – сегодня на территории сада представлено больше 6000 различных видов представителей земной флоры.
В Ботаническом саду созданы уникальные для северных регионов планеты растительные фонды: из них 1800 тропических и субтропических растений, декоративных древесных и кустарниковых открытого грунта – 796, декоративных травянистых – 1200, лекарственных – 535, плодово-ягодных – 235, кормовых – 514, овощных – 421, редких и исчезающих из флоры Томской области – 551 вид и видообразец.
Созданный когда-то одним ботаником П.Н.Крыловым, ботанический сад имеет на данный момент 85 человек в штате, среди которых кандидаты и доктора наук.